I programmi di dottorato sono corsi avanzati di studio per studenti che, dopo la laurea, intendono continuare gli studi per una carriera nel campo della ricerca, o nelle professioni che richiedono una più elevata qualificazione accademica. Sono dotati di un numero limitato di borse di studio. L’ammissione a ciascun corso di dottorato, e alla relativa borsa, si consegue mediante concorso nazionale, generalmente a cadenza annuale. Il concorso, che si svolge presso la sede stessa del corso, consiste in una prova scritta, un colloquio, e una valutazione degli eventuali titoli presentati dal candidato. Nell’Ateneo di "Tor Vergata" i corsi di dottorato attualmente attivati nell’area economico-commerciale sono i seguenti:

Dottorato in Banca e finanza
Coordinatore: Prof. Alessandro Carretta
Sede amministrativa: Dipartimento di studi economico-finanziari e metodi quantitativi

Sedi consorziate: Università di Napoli "Parthenope", Libera Universita’ Internazionale di Studi Sociali - LUISS - di Roma, Libera Università del Mediterraneo "LUM" di Casamassima (BA), Università della Tuscia - Viterbo , Universita’ di Cagliari, Universita’ di Lecce, Università di Perugia, Universita’ di Roma “Tor Vergata”, Universita’ di Roma Tre, Universita’ di Sassari, Universita’ di Siena.

Dottorato in Diritto commerciale
Coordinatore: Prof. Giuseppe Santoni
Sede amministrativa: Dipartimento di studi sull'impresa

Sedi consorziate: Università di Napoli "Parthenope", Libera Università Internazionale di Studi Sociali - LUISS - di Roma, Università dell'Aquila, Università di Cagliari, Università di Lecce, Università di Roma "Tor Vergata", Università di Roma Tre, Università di Sassari, Università di Siena.

Dottorato in Diritto ed Economia dell'Ambiente
Coordinatore: Prof.ssa Laura Castellucci
Sede amministrativa: Dipartimento di Studi economico finanziari e metodi quantitativi

Dottorato in Diritto del lavoro, sindacale e della previdenza sociale
Coordinatore: Prof. Sergio Magrini
Sede amministrativa: Università di Roma "Tor Vergata"

Dottorato in Econometria ed Economia empirica (*)
Coordinatore: Prof. Franco Peracchi
Sede amministrativa: Università di Roma "Tor Vergata"

Dottorato in Economia delle istituzioni e dei mercati monetari e finanziari
(Doctorate in Money and Finance)
Coordinatore: Prof. Gustavo Piga
Sede amministrativa: Dipartimento di economia e territorio

Sede consorziata: Libera Università Internazionale degli Studi Sociali Guido Carli di Roma (LUISS).

Dottorato in Economia e gestione delle aziende e delle amministrazioni pubbliche
Coordinatore: Prof. Francesco Ranalli
Sede amministrativa: Dipartimento di Studi sull'impresa

Università convenzionate: LUISS "Guido Carli" di Roma e Università di Roma Tre.

Dottorato in Economia e Organizzazione delle Imprese
Coordinatore: Prof.ssa Cosetta Pepe
Sede amministrativa: Dipartimento di Studi sull'Impresa

Dottorato in Economia Internazionale
Coordinatore: Prof. Giancarlo Marini

Sede amministrativa: Università di Roma "Tor Vergata"

Dottorato in Diritto Privato "Le fonti della giustizia commutativa"
Coordinatore: Prof. Giovanni Doria
Sede amministrativa: Università di Roma "Tor Vergata"

Dottorato in Teoria economica e istituzioni
Coordinatore: Prof. Luigi Paganetto
Sede amministrativa: Dipartimento di economia diritto e istituzioni

Sede consorziata: Università di Cassino

Dottorato internazionale in La tradizione europea del pensiero economico
Responsabile per Tor Vergata: Prof. Annalisa Rosselli
Sede amministrativa: Macerata